Resposta direta
Use o SINAPI como referência principal para edificações e serviços urbanos compatíveis; use o SICRO para infraestrutura de transportes. A natureza do serviço e a aderência da composição devem orientar a escolha.
Entenda
A base não deve ser escolhida apenas pelo menor preço. Compare descrição, unidade, premissas, equipamentos e produtividade com o objeto. Uma obra pode conter serviços de naturezas diferentes e, de forma justificada, utilizar referências distintas. O orçamento precisa manter data-base e critérios coerentes, sem misturar metodologias de maneira automática.
Exemplo
Um prédio público tende a usar SINAPI. Uma obra rodoviária tende a usar SICRO. Se o prédio inclui acesso viário especial, esse trecho pode exigir referência de infraestrutura compatível.
Atenção
Observe a legislação e as regras da contratação, além das orientações do órgão responsável. Quando a base não representar o serviço, justifique composição própria ou outra fonte idônea.
Como verificação final, registre o sistema, a competência, a localidade, a condição de desoneração e os ajustes efetuados. A rastreabilidade da fonte é tão importante quanto o valor adotado, especialmente quando houver combinação de referências ou pesquisa de mercado.